Innanzitutto, non tutti gli alieni in Star Trek sono umanoidi: vi sono vari esempi di forme di vita aliena, di varie forme e dimensioni. Sono tutti di forma umanoide gli alieni "ricorrenti", per ovvi motivi di budget: realizzare forme di vita "aliena" usando modelli reali o in computer grafica incide pesantemente sul costo per la realizzazione di un singolo episodio, figurarsi in una stagione o in una serie intera. Detto questo, è stata comunque data una motivazione coerente con l'universo di Star Trek del perché vi siano tante razze umanoidi: nell'episodio "Il segreto della vita" di Star Trek The Next Generation si parla di una specie che 4 miliardi di anni fa ha seminato frammenti del proprio DNA nei mondi in formazioni. Questo spiega perché molte specie di star trek sono umanoidi e hanno molte cose in comune.